Ο ρόλος του γιαουρτιού στην υγεία του πεπτικού συστήματος είναι γνωστός κυρίως για τους καλούς και ωφέλιμους μικρο­οργανισμούς που περιέχει. Οι ζωντανοί μικροοργανισμοί ή αλλιώς «καλά βακτήρια» ενισχύουν την εντερική μικροχλωρίδα, η οποία ρυθμίζει την ανάπτυξη και την λειτουρ­γία του ανοσοποιητικού συστήματος, βοη­θά την μεταβολική δραστηριότητα, στην απορρόφηση θρεπτικών συστατικών κλπ. Το γιαούρτι θεωρείται πλούσια πηγή ασβεστίου ενώ αποτελεί καλή πηγή μαγνησίου, καλίου και φωσφόρου. Το ασβέστιο είναι ένα από τα βασικότερα μεταλλικά στοιχεία στον οργανισμό καθώς αποτελεί βασικό δομικό συστατικό των οστών, είναι απαραίτητο για την ομαλή λειτουργία του νευρικού συστήμα­τος, την ρύθμιση της αρτηριακής πίεσης κλπ.